圆通寺与其他佛寺不同的是，进山门后不是上坡，而是要沿着中轴线一直下坡，大雄宝殿地处寺院的最低点。主体建筑有圆通宝殿、八角亭、"圆通胜境"牌坊等。布局严谨、对称，主题突出，杂而不繁。加上其园林式的建筑风格，青山、碧水、彩鱼、白桥、红亭、朱殿、彩廊交相辉映，景色如画。

    大雄宝殿又叫圆通宝殿，其结构和佛像都具有元、明建筑风格。大殿正面内柱上，彩塑有两条盘柱聆听佛祖讲经的飞龙，形神兼备，活灵活现，龙各盘一柱，高十来米。二龙相向，舞爪咧须，作欲飞状。属于我国佛寺中的上乘泥塑珍品。

    大殿后的石崖上，有历代文人墨客的摩崖石刻、诗词题对。在峭壁下的圆亭旁，有一砖砌高台，叫"咒蛟台"。清乾隆年间，撰写大观楼长联的著名诗人孙髯翁晚年贫困，曾在咒蛟台卖卦算卜，自号"蛟台老人"。

    圆通寺是由大乘佛教（又称北传佛教）、上座部佛教（俗称小乘佛教）和藏传佛教（也就是喇嘛教）三大教派的佛殿组成，以大乘佛教为主。因此，到这里您不必跑很多地方，就可对佛教三大教派的殿宇一览无遗，还可对三大教派不同的宗教风格有一个初步的了解。

    民间传说：圆通寺大雄宝殿内二龙曾在清嘉庆年间飞出殿外，与翠湖九龙池的九条白龙格斗，斗得难解难分，天昏地暗。

    "咒蛟台"传说：相传在元代，晋宁盘龙寺的开山和尚觉照云游昆明，发现圆通洞蛟龙作怪，乃筑台诵经咒蛟并降服了蛟龙，故名"咒蛟台"。