水目山是云南开创最早的佛教圣地之一，唐宪宗元和八年（813年），南诏诸大臣请建此刹。普济庆光禅师用禅杖凿地，"而有清泉涌出，因名水目"。开堂之日，六诏的首领都来祝贺。香火最旺时，号称"和尚千人，尼姑八百"。

    历代都有高僧住水目山，如唐代的开山祖普济庆光禅师，宋代的净妙澄禅师，晚清时期的无往如禅师、非相行禅师街头在理国时曾有不少王族中人在此出家为僧。

    清初有名的担当和尚，也曾在此长住。从唐朝起，水目山寺院经过多次修理工建，逐渐形成了一个建筑群落，有水目、贤填充、地藏寺、灵光寺、塔院、三教阁、毗卢阁、弥陀庵等寺观。

    水目山寺分为上、中、下三庵，现仅存的下庵，为清代宣统二年（1910年）重建，1984年至1987年重修。下庵依次是山门、塔院、前院、西北配殿、大雄宝殿，南北两边有僧房、香橱、职事堂、斋堂、茶室、云会堂。下庵前面，有历代僧人精心培植的梨数十亩。